تعتبر الأجهزة البلدية من أكثر المؤسسات التي تحتاج إلى تطوير مستمر لحوكمة إجراءاتها المؤسسية. وقد شهدت السنوات القليلة الماضية إعادة هيكلة لكثير من الأنظمة المؤسسية المحلية والبلديات بهدف رفع كفاءة الأداء وتحسين الخدمات البلدية. ويسعى المعهد إلى تحليل ممارسات الحوكمة الحضرية وتقييم الأساليب والأدوات التي تنتهجها البلديات العربية في الإدارة وتطوير قدراتها المؤسسية. ويغطي هذا المحور مواضيع التحول نحو اللامركزية وتطوير النهج التشاركي في صنع القرار البلدي من خلال المجالس واللجان المعنية بالإضافة إلى مواضيع التعاون بين البلديات في تقديم الخدمات للسكان.